胰腺癌是消化系统常见的恶性肿瘤，所以在诊断时也容易和消化系统其他疾病相混淆，比如以下4种疾病：
慢性胃部疾病
多数人患有胃病后，会出现腹部疼痛，但多与饮食有关，黄疸少见，利用X线钡餐检查可以明确诊断。
胆石症、胆囊炎
出现胆石症或者胆囊炎后，患者多呈现腹部阵发性绞痛，急性发作时常有发热和白细胞增高症状，黄疸多在短期内消退或有波动，患者无明显体重减轻。
急慢性胰腺炎
急性胰腺炎多有暴饮暴食史，病情发作急骤，血白细胞、血尿淀粉酶增高。慢性胰腺炎可出现慢性肿块和黄疸，这种情况和胰腺癌非常相似，而胰腺深部癌压迫胰管也可出现慢性炎症，这给诊断带来一定难度，可在剖腹探查手术中用极细穿刺针作胰腺穿刺活检，以助鉴别。
壶腹周围癌
壶腹周围癌起病骤然，也会有黄疸、消瘦、皮痒、消化道出血症状，但是引起的黄疸常呈现波动性，并且腹痛不明显，常并发胆囊炎，以反复寒战、发热较为多见。两者鉴别时比较困难，要结合超声和CT来提高确诊率。另外，壶腹周围癌较为少见。
