肛瘘术后的治疗时间的长短，与瘘管的大小，病情的复杂程度，病人的体质情况及手术方法有密切关系。一般来说，皮下肛瘘术后2周左右可治疗，单纯性低位肛瘘，大约需3周左右的时间才能渐愈;少数高位性难治瘘，疗程就相对更长一些。
肛瘘手术后应注意的事项：
1.注意肛门部的清洁卫生，坚持便后坐浴：肛门直肠仍需要一个相对清洁的环境，所以主张肛门直肠部手术，出院以后便后及时清洗、中药坐浴或换药，既可减少排便时直接对创面的刺激，又可减少污染的机会，同时配合局部按摩，促进创面愈合。
2.适当休息，避免过劳：休息对减轻术后出血及肛门局部症状十分重要，因此我们建议患者适当休息，并避免重体力劳动。
3.清淡饮食，注意饮食卫生： 忌食辛辣刺激性食物一月，如酒、葱、大蒜、辣椒等。而应食含纤维素丰富的食物，如青菜、竹笋等。 少食鱼、虾、蟹等发物及油煎熏烤的食物。宜多食清淡易于消化的食物以及新鲜水果和新鲜蔬菜，饮食应注意纯洁，避免腹泻。
