痔疮肛瘘是常见病，人们患了肛瘘，往往误认为患了痔疮，从而忽视治疗。据临床资料显示，80% 以上的患者出现便血、瘙痒、便痛等症状时，一般凭感觉自行判断，仅凭医生的视诊和指诊来判断病情，误诊、漏诊率居高不下，成为肛肠病反复发作、久治不愈的重要原因。
肛瘘多为一般化脓性感染所致，少数为特异性感染，如结核、克隆病、溃疡性结肠炎更少见。直肠肛管外伤继发感染也可形成肛瘘，直肠肛管恶性肿瘤也可溃破成瘘管，但都少见，与一般化脓性肛瘘有明显区别。
有人推测性激素的影响是肛瘘发生的主要原因在青春期人体自身的性激素开始活跃，随即一部分皮脂腺，特别是肛腺开始发育增殖，男青年较女性增生明显。由于肛腺分泌旺盛，若加上肛腺排泄不畅或肛腺管阻滞，则易感染引起肛腺炎，这可解释男性青壮年为何肛瘘发病率较高。
而女性肛管导管较直不如男性弯曲，分泌物不易淤积，所以女性肛瘘发病率较低。人到老年，与其他皮脂腺普通萎缩的同时肛腺也随之萎缩，故老年人肛瘘少见。
