在临床治疗中，白塞氏病根据发作与复发、迁延与缓解的长期、缓慢的进行性的加剧表现分为急性活动期、中间期恢复期与临床缓解期三期。治疗白塞氏病是根据不同分期的特点进行医治。
1、急性活动期：脉象多滑数或弦数，舌质淡红或黯红，苔薄黄，此属湿热内聚，郁久化火之证，可用导赤散加芦根、滑石等清心降火，导热与湿邪从小便而出。若患者发作源于情志过极，肝经火旺，则大多伴有心烦品苦，肋胁胀痛等，可用丹栀肖遥散疏肝泻火、清热凉血;病变中若出现高热烦渴、大便秘结、腹胀腹痛、血象明显升高，血沉、CRP急剧增高者，属邪热内炽。气分热盛，可用白虎汤合小承气汤清气除热，通腑泻浊。
2、中间恢复期：症见口腔或外阴溃疡好转、发热、便秘、腹胀、腹痛已基本消失，血象、血沉、CRP等开始下降或基本恢复正常。然本病为一种全身性广泛性的小血管炎症性病变，故此期的治疗应是清解余邪、活血化瘀，可用复元活血汤加丹参、枳实等治疗。若余邪较重，低热不退，烦躁不解，或加用柴胡疏肝散。
3、临床缓解期：此期临床症状与体征基本消失或完全消失，血象、血沉、CRP等实验检查指标也恢复正常。初发患者或虽多次发作但无重要脏器受累者常无明显的阴阳气血偏盛偏衰表现，故此期治疗白塞氏病的原则是提高机体免疫功能，延长缓解期与减少复发，可用十全大补丸口服，持续服用1至2年;若有阴阳偏盛表现，当根据阴阳之偏盛衷情况，分别以左归丸、右归丸、杞菊地黄丸、金匮肾气丸等治疗，且需持续用药1至2年。
治疗白塞氏病时若伴有关节、皮肤、肾脏、肠道、神经系统损伤者，或在后期出现器官功能严重受累者，应该根据情况详细辩证，制定相应的制剂或方药。
