成人沙眼衣原体和支原体的感染，主要是通过性传播。而儿童的感染主要是通过间接接触引起，特别是幼女由于其母亲或保姆感染本病，通过间接接触引起感染。如母亲感染支原体可以通过生殖道在分娩时引起新生儿感染。在胎膜完整的情况下，从羊水、胎盘和胎儿血液中可分离出支原体，因而证明胎儿在宫内也可发生感染。
沙眼衣原体与淋病的关系。沙眼衣原体与淋病有非常密切的关系，淋病对衣原体感染，起着激活与促进的作用。衣原体感染的危险因素中，第一位是合并有淋病。淋病患者的沙眼衣原体的分离率也明显高于不合并淋病的人群。实验研究表明，淋病双球菌的存在使沙眼衣原体在宫颈和尿道的复制能力提高一百倍。淋病双球菌还对沙眼衣原体的复发起到加速作用。有人报道，沙眼衣原体感染引起的尿道炎复发者，约半数合并有淋病。这就不难理解淋病与沙眼衣原体引起的尿道炎常常有合并感染的原因了。
临床表现。非淋病尿道炎的临床表现男女不尽相同，且对孕妇和新生儿有很大的影响，详细情况请点击男性非淋菌性尿道炎、女性非淋菌性尿道炎和非淋对孕妇和新生儿的影响。
