在腹腔镜下，医生可以全面地评价患者的盆腔情况，了解输卵管是否通畅。通过手术，还可以切除所有可见的内异症病变，恢复和保持盆腔正常的解剖学关系。术中的大量冲洗，稀释了炎性反应因子，使盆腔的微环境得以改善。一个成功的腹腔镜内异症手术，要求有精细的组织操作，避免卵巢血供的破坏，以及适当使用预防粘连药物。这样，可以大大提高患者的受孕概率。
也许有读者会问，如果不是通过腹腔镜，而是以开腹手术治疗内异症不孕，会不会治疗更彻底、术后受孕率更高呢?目前，国内尚无这方面的研究来比较腹腔镜和开腹手术对于妊娠的影响。一般认为，腹腔镜和开腹手术治疗内异症不孕，其效果均优于药物治疗，但两种方法之间无显著差别。国外则有报告，微、轻度内异症不孕患者手术治疗后3年内的累积受孕率，腹腔镜与开腹手术无明显差别：而中、重度内异症不孕者，腹腔镜手术后的妊娠率要高于开腹手术后。国外统计，腹腔镜激光手术后，总妊娠率为56%。
总之，目前的内异症治疗药物，如丹那唑、孕三烯酮(内美通)或孕激素治疗，均不能提高内异症不孕患者的妊娠率，手术应是内异症不孕患者的首选。一般地说，腹腔镜术后的半年内是患者妊娠的最好时机。
