肾囊肿引起的并发症有：
（1）肾脏癌肿：呈占位性病变，但易发于深部，从而引起更明显的肾盏弯曲。血尿常见，而囊肿则不见。当肾实质肿瘤压在腰大肌上面，在腹平片上就看不到肌肉的边沿，而囊肿则依然可见。出现移动的证据（如体重减轻、乏力、触及锁骨上淋结肿大、胸片表示有移动性结节）、红细胞增多症、高钙血症及血沉加快都提醒为癌肿。
（2）肾痈：本病罕见。采集病史时，可发现在突起发热及局部疼痛前数周有过皮肤感染史。尿路造影表示其病变与囊肿及肿瘤相似，但由于肾四面炎影响，使肾轮廓及腰大肌影模糊不清。此时，肾脏多较固定。将患者在仰卧及树立时肾脏位置加以比较即可证实。血管造影可表示一无血管的病损。镓-67扫描可表示病损的炎症性质，但感染的单纯性肾囊肿也可有相似的表现。
（3）肾积水：症状和体征可与单纯性肾囊肿的表现完全一致，但尿路造影则截然不同。囊肿引起肾脏变形，而肾积水则表现为由于阻塞所致的肾盏和肾盂的扩张。急性或亚急性肾盂积水由于肾盂内压的增高常产生更为局限的疼痛，并因感染而易于使其表现复杂化。
另外，肾囊肿多发生于：工作或生活在污染环境里的人容易得肾囊肿。情绪不稳定的人：情志的异常变化，特别是长期过度抑郁或惊恐的人尤其爱患肾囊肿。家族中有肾囊肿遗传史的人。劳累过度的人们：包括体力劳动过度、脑力劳动过度而又缺乏体育锻炼或锻炼方法、强度不当者都易患肾囊肿。
