小儿两岁前直肠会阴曲较小，肛管前壁受粪便直接压力大，因而前壁易发生隐窝炎；肛管后壁有耻骨直肠肌加固，肛管前壁相对薄弱，感染时炎症易向前方穿透，破溃。故内口及瘘管走行后位者少见，瘘管较浅，多呈直线形。小儿齿状线距肛缘位置较成人近，擦洗肛周时动作宜轻柔，否则可以损伤肛隐窝，腹泻时粪便易填塞于肛隐窝内，从而增加感染的可能。而临床诊治过程中有很多诊断为复杂性肛瘘的患者，均为患者担心因手术损伤肛门功能而延误治疗所治。男性小儿肛瘘，外口为皮肤，形成肉芽后暂时关闭，内口进入的细菌和粪便在引流不畅时，局部形成脓肿，破溃减压后可再次愈合，反复发作形成复杂性感染性肉芽瘘。女性小儿肛瘘，肛瘘内口多为黏膜组织，易使瘘管内层黏膜化，成为永久性肛瘘。女性舟状窝部位的直肠阴道间隔仅5MM，极薄弱疏长，直肠阴道间隔的厚度增加，直肠阴道修补的成功率会增加，必要时可以选择肌瓣或网膜加强直肠阴道间隔。
为何小宝宝也会得肛瘘？
孩子屙尿后换尿布时，年轻的父母常常是顺手用干尿布擦屁股，因新生儿的大便较粘，需要反复擦几次才能擦干净，其结果就增加了损伤婴儿皮肤的机会。还有的家长用废纸来擦屁股，那容易使婴儿的肛门粘膜受到损伤，一旦感染后容易引起肛门炎，导致肛门脓肿，如果破溃后还易形成肛瘘。
男孩与女孩发生肛瘘，其临床表现也各不相同。女婴肛门发炎后红肿疼痛，一旦形成脓肿后肛周皮肤肿胀发亮，中心软化，破溃后大便可从阴道口处女膜部位的瘘口排出，由于大便几乎全从阴道口排出来，因而肛门不排便，大约10天左右，肛门才逐渐恢复排便，随着阴道排便的减少，肛瘘周围炎症才逐渐消退，但女婴的肛瘘一般不会自动愈合，以后遇到腹泻时粪便仍可从瘘口漏出，一般到2岁后漏便现象减少，但若要彻底治愈肛瘘，则必须带孩子到医院肛肠科请专科医生手术治疗。
