1.已有门静脉癌栓者须酌情考虑或去除癌栓。
2.即使操作超选择顺利进行，由于高压注射等原因，可造成误栓，分流及可能有不可避免的微转移产生。
3.有的病人一次治疗后血管即堵塞，以致再操作困难
4.对癌块太大者疗效欠满意。
5.肝癌主要供血依赖肝动脉，但癌块周围有门静脉血供，癌细胞可以“苟安偷生”。
6.操作有一定难度，导管应超选择进入供血动脉疗效才佳，但有时进入肝动脉都很困难。而有的肝癌可多血管供血。
7.尽管超选择进入，仍有明显副作用，临床资料显示，消化道反应最多。
8.对正常肝细胞仍有损伤，少数病人甚至出现肝机能不全。
