虽然药物流产有不少优点，但也有它的局限性及副作用，为了保证妇女健康，严格禁止在一般药房出售流产的药物，药物流产者必须在有条件的医疗机构中进行。
进行药物流产的一般程序如下：
1.用药前严格筛选，包括询问病史，进行全身体检和妇科检查，作实验室检查，如尿妊娠试验、阴道清洁度、滴虫和霉菌、血常规和血型，必要时做B超检查。
2.医生详细交待服药方法、药物疗效及可能出现的副作用，征得同意后方可用药。
目前常用剂量：
（具体方法停经≤49天之健康早孕妇女，空腹或进食2小时后，口服25mg米非司酮片一片，早晚各一次，共服三天，第四天清晨口服米索前列醇 600ug（200ug/片×3片），或于阴道后穹隆放置卡前列甲酯栓1枚（1mg）。卧床休息2小时，门诊观察6小时。注意用药后出血情况，有无妊娠产物排出和副作用。
3.流产过程中的监护：
住院观察期间除注意血压、脉搏、药物副作用外，所排出的大小便均需保留在干净便盆内，由专人检查并记录有无胎囊及其排出时间，胎囊大小和出血量。如排出胎囊前后有活动性出血，可给宫缩剂或立即刮宫止血。
观察6小时后如胎囊仍未排出，出血不多，可回家，按医生规定日期随诊。如在家中排出组织，须带给医生察看。
