在品级上来看，尚书要比总督大，不过两者拥有的权利是不一样的。尚书为从一品，而总督是属于正二品，但是在清廷的实际情况中，总督的权利要比尚书更大一些，时代不同权利自然有所不同。
尚书是从一品的京官，在皇帝身边做事，地位自然也是很高的。不过尚书虽然地位很高，但手中并没有相对应的权利。总督大人虽然是正二品衔，但是总督的手中握有军事和行政大权，也是真正的封疆大师，地方诸侯。
在清代时期，为了加强对各地的统治，清朝的总督都会升职，一般都是给加兵部尚书衔或者东宫三师衔，从而成为从一品，而且手中的权势依然还在。
在清朝的总督中，直隶、两江、湖广、两广、闽浙这五个地方的总督，权势和地位比较大，一般都会以兵部尚书、右都御史衔兼任。在这种情况下，任职兵部尚书副职的兵部侍郎衔总督，品秩和实权就要低于兵部尚书了。
