脂肪乳剂的临床应用在我国已有多年，但仍有些不规范的用法，要合理使用应做到如下。
静脉营养时，应先将各种营养素在体外混合后输入。
只有热量物质(如葡萄糖、脂肪乳剂)、含氮物质(复方氨基酸)、维生素等营养素同时输入，才能发挥最佳促进蛋白质合成的作用。要避免营养制剂的单瓶输注，不但疗效差，还易发生不良反应。
应注意个体化给药。
严格按照机体的能量需求和代谢能力进行输注，采用输注全肠外营养液(TNA液)的方式，针对不同病情可适当添加含ω-3脂肪酸，橄榄油或维生素E的脂肪乳，使脂肪乳剂的作用能够充分发挥。
在一般情况下，脂肪乳剂提供的能量应占总热量的25%~30%，或占非蛋白能量的30%~50%。脂肪乳剂的推荐摄入量为1.0~2.0克甘油三酯/千克，其输注速度为0.1~0.15克甘油三酯/(千克·小时)。剂量过大、速度过快输注可产生不良反应，包括心悸、出汗、呼吸急促、高甘油三酯血症、凝血功能异常、肝功能异常、网状内皮细胞系统功能受损、免疫抑制等临床表现。因此，输注脂肪乳剂时应监测血浆甘油三酯水平，避免过量应用脂肪乳剂所致的损害。
在使用过程中，要确保脂肪微粒的稳定性。
一旦脂肪乳剂的稳定性遭到破坏，脂肪微粒裂解、融合，可能导致脂肪栓塞的严重后果。其影响稳定性的因素很多：如溶液的酸碱度、电解质及温度等。不能在脂肪乳剂中加入电解质溶液(可是在临床上，常加入钙剂、镁剂和磷酸盐等，应该避免)，以及其他药物。
脂肪乳剂的不良反应发生较少，但仍有可能会发生输液反应、血尿、急性肾衰、精神异常、过敏反应、心律失常、恶心、呕吐、外周静脉炎等，尤其是脂肪乳剂导致的脂肪超载综合征更应引起临床医师的充分重视。
脂肪超载综合征为脂肪廓清能力下降所致，可有嗜睡、发热、呼吸急促、心率加快、血压升高或降低、血小板水平降低、贫血、高脂血症、肝功能异常及昏迷等临床表现。因此，为减少不良反应的发生，应保证脂肪乳剂配制和输注过程的规范操作，避免超长时间、剂量过大、输注速度过快的应用。
对于少数特殊患者，如高胆固醇血症，凝血功能障碍或免疫功能不良者，应慎用或不用脂肪乳剂。
