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HBV感染以后，根据免疫的应答可以分成免疫耐受，免疫清除，非活动，再活动4个阶段。只有在免疫清除和再活动的阶段才适合做抗病毒治疗。
抗病毒治疗有两大类的药物：
1、以干扰素作为免疫调节机的一大类；
2、口服的核苷（酸）类似物。其最终的结局是不一样的。
多种临床病例表明：经过干扰素的治疗，长期随访的e抗原阳性病人转阴的比例很高。 干扰素治疗的优势，具有免疫调节和抗病毒的双重作用，目前尚未发现与干扰素治疗相关病毒的耐药。
干扰素的治疗主要强调持续的应答，在治疗过程中的应答，在停药以后应答依然持续。
第二类药物：口服的核苷（酸）类似物在治疗的过程中有应答，但在停药以后绝大多数的病人都会复发，所以必须长期用药。因而很多临床医生在对乙肝的治疗又回归到重视维持应答的这个方面了，也就是说回到了干扰素的治疗。
佩乐能治疗慢性乙肝使e抗原的消失的比例达到36%。佩乐能治疗e抗原阳性的慢乙肝还有很多的规律可循：e抗原消失的比较早的病人，最终HBV DNA下降的比较快。曾经用过普通干扰素或者用过拉米夫定抗病毒治疗没有应答的病人，如果换用佩乐能治疗仍然可以取得像初治病人一样的水平。在佩乐能抗病毒治疗过程中，延迟的应答最终的应答率是最高的，可以到达63%。
干扰素抗病毒治疗与口服抗病毒治疗是完全不同的规律，不能进行等同的比较。 佩乐能目前批准的剂量是1.0ug/kg，但有不少教授认为1.5ug/kg效果会更好。
什么样的病人是佩乐能治疗正确的病人呢？
正确时机是指该病人处在免疫清除和再活动的阶段，转氨酶水平越高越好，对于普通干扰素或者用过拉米夫定抗病毒治疗没有疗效的病人使用佩乐能的效果是不受影响的。
年轻病人，对干扰素治疗有一定的理解和配合，没有干扰素的禁忌症，基因病是最理想的，愿意尝试短期疗程，对表面抗原的阴转有迫切愿望的患者。
只要我们我们选对病人，选对正确的方案和疗程，我们就一定会提高抗病毒治疗乙肝的疗效，特别是经过干扰素治疗病人的长期追访，我们就不难发现更多的病人实现表面抗原的阴转。
正确疗程使用佩乐能治疗慢乙肝1年，随访半年。如果把随访的病人时间延长，就能发现更多的病人出现表面抗原阴转。
