氟罗沙星不良反应较多见，其发生率与剂量呈相关性。
1.消化系统：可有味觉异常、食欲减退、恶心、呕吐、腹痛、腹胀、腹泻及便秘等。偶见血清氨基转移酶升高。
2.精神神经系统：可有头昏、头痛、失眠、眩晕、情绪不安、兴奋等，可见抽搐、幻觉、幻视等，偶见严重失眠或幻视。
3.血液系统：偶可引起白细胞及血小板减少，嗜酸粒细胞和单核细胞增多。
4.过敏反应：可表现为呼吸困难、心悸、水肿、皮疹、皮肤瘙痒、血管神经性水肿，偶可发生过敏性休克。
5.光敏反应：常见，且其发生率随剂量增加而增高。应避免直接或间接暴露在阳光及紫外线下，夜间服用可减少光毒性。一旦发生过敏反应，应即停药及进行相应处治。
6.其他：
偶见休克、间质性肺炎，低血糖反应。也可引起血肌酐及尿素氮增高。国外报道，一项多中心的临床研究中，1182例口服本品，其中发生不良反应53例，占4.48%。
主要为中枢神经系统(失眠、头痛)反应21例，消化系统(腹部不适、呕吐、嗳气)反应22例，过敏反应6例，其他反应较少见。在临床进行分化检验的836例中，有12例异常，包括ALT、AST升高6例，嗜酸粒细胞升高2例，尿素氮和肌酐升高各1例。
另一报道，应用氟罗沙星治疗妇产科感染患者114例，其中发生不良反应者有4例，约占3.5%，包括胃肠道反应，腹泻各1例，AST、ALT升高各1例。
