一是先天因素，包括染色体异常、精子、卵子异常等。其中，精子、卵子异常也可能因后天炎症引起。
二是内分泌功能不足，表现为孕激素(黄体功能)不足。在怀孕的前十周，胚胎的发育都是靠卵巢分泌孕激素、绒毛膜促性腺激素支持，直到怀孕近三个月胎盘功能完善，才转靠胎盘支持。所以早期孕激素不足，胚胎也难以发育。
三是有器质性病变，如子宫畸形、子宫肌瘤等，造成宫腔细小、胚胎着床位置不好或受压迫。
四是免疫功能的问题，如由于封闭抗体缺乏，胚胎被母体认为是异物而产生排斥，从而引起流产。
五是外力作用，如碰伤、激烈运动、颠簸以及性生活等，对早期的胚胎都可能形成巨大冲击。
