须与结核性溃疡、梅毒溃疡、软下疳和上皮癌等溃疡相鉴别。其中溃疡性结肠炎和肉芽肿性结肠炎并发之肛裂极易鉴别。
1、肛门皮肤擦伤 肛裂早期需与肛门皮肤擦伤相鉴别。
2、肠道炎性疾病 某些肠道炎性疾病可伴有肛门周围的溃疡，诊断时应注意鉴别。
①肛管结核溃疡；②克罗恩病肛管溃疡；③梅毒溃疡；④溃疡性结肠炎并发的肛裂。
